在Unity手游开发中，后端框架的选择应根据项目需求、团队熟悉度以及技术栈来决定。以下是一些建议的框架和工具：
Unity Engine：
这是Unity的核心框架，提供了游戏对象管理、渲染、碰撞检测、物理引擎等功能。开发者可以通过Unity Engine构建游戏世界和处理游戏逻辑。
Unity Editor：
这是Unity的可视化编辑工具，用于创建、组织和管理游戏资源、场景以及执行游戏逻辑。通过Unity Editor，开发者可以在编辑器中进行场景搭建、组件添加、脚本编写等操作。
Unity UI：
用于构建用户界面的框架，包括按钮、文本、图像等常见UI元素。
Unity Networking：
用于网络通信的框架，支持多种网络协议和模型，包括客户端-服务器、对等以及云服务等。
IL2CPP VM：
这是一个基于IL2CPP虚拟机的热更新框架，如huatuo/HybirdCLR，适用于需要热更新的项目。
GameFramework、MotionFramework、ET：
这些是商用的整体框架，虽然不主张直接使用，但它们包含了很多值得学习的设计理念与习惯。可以根据项目实际来定制一个适合自己的开发模式与工作流。
luban与FlashExcel：
这些是开源的数据配置表框架，适用于处理各种数据格式，如Excel、JSON、YAML等。
EmptyGO、Simple GameManager、Manager Of Managers：
这些是Unity中常用的架构方式，可以根据项目规模选择合适的架构。
建议
小型项目：如果项目较小，可以考虑使用Unity自带的框架和工具，如Unity Engine和Unity Editor。
中型项目：对于中型项目，可以根据团队熟悉度和项目需求选择合适的框架，如GameFramework或MotionFramework，并结合IL2CPP VM进行热更新。
大型项目：对于大型项目，建议采用模块化的架构，如Manager Of Managers，并结合Unity UI和Unity Networking进行开发。
最终选择哪个框架或工具，应综合考虑项目需求、团队技能和技术栈，以确保开发效率和项目质量。