《问道》手游的故事背景设定在鸿蒙开化时期，中洲大陆昆仑之巅的鸿钧上人创立了道教，并收下了三个徒弟。这三个徒弟分别是太上老君、元始天尊和通天教主，他们分别创立了道教的人道、阐教和截教三个分支。三教主遵循鸿钧上人的教诲，广收门徒，传播道教。然而，修仙之路并非一帆风顺，修行者需要经历小劫和大劫的考验。
在商周交替之际，正值修仙一千五百年大劫降临，三教主共议封神榜，以观众仙道行浅深。然而，封神一役导致道门内部阐教和截教不和，修仙众人遭受毁灭性打击，西方教派也参与其中。最终，鸿钧上人出面调停，平息了这场纷争。通天教主因过错被带回紫霄宫受到惩罚，被仙法禁锢，只能在昆仑山上修行悔过。
千年后，鸿钧上人云游四海，不知去向，而通天教主也习惯了被禁锢的生活，除了修真炼气，更多时间在断崖边静诵《黄庭》。游戏的故事主线围绕主角的成长历程展开，从初出茅庐的懵懂少年，经过江湖历练，最终成为一代道家宗师。
此外，游戏还融入了幽默搞笑的语言风格，谱写了一场从初出茅庐的懵懂少年，经过江湖中的一番历练，最后终成为一代道家宗师的故事。