《庆余年》手游中的副本包括以下几种：
庆齐争锋：
这个副本可以获悉北齐这些人物之间更多不为人知的故事，主要涉及沈重与上杉虎之间的恩怨。
鬼门铁狱：
在这个副本中，玩家可以对北齐锦衣卫的特殊监狱一探究竟，并与新任指挥使卫华、副指挥使萧元炳等北齐高手一决高下。
江南水寨：
通过这个副本，玩家可以解锁原著中没有提及的隐藏剧情，获悉江南水寨老供奉、夏栖飞等人的真实面目。
澹泊纪事：
这是一个日常组队副本，有几率获得紫色、黄色品质的装备。澹泊纪事每天可以打两次，建议参加与自己等级段相匹配的副本以获得对应等级段的装备。
万金舫：
在范闲下江南、掌内库过程中出现过的神秘九品高手，他的故事可以在这个副本中解锁。
牛栏街突围：
这是澹泊纪事中的一个副本，推荐等级40级，推荐修为15000，难度相对较低，适合三人以上参加，可以获得金装“沧海·浩气套”的装备。
夜闯皇宫：
同样是澹泊纪事中的一个副本。
王帐龙庭：
这也是澹泊纪事中的一个副本。
断川折浪 和 覆沧海：
这两个副本都是蓄力型技能，并且会出现范围判定，需要玩家利用蓄力的时间尽情输出，在释放前躲开。
魔界降临：
这个副本充满神秘与奇幻的异界场景，玩家需要面对各种魔物和恶魔，同时应对诡异的魔法和陷阱，难度极高，但奖励丰富。
蓬莱之战：
这个副本充满仙气与幻想的海岛场景，玩家需要面对各种神秘的仙人和神兽，同时应对复杂的机关和谜题。
鬼城迷雾：
这个副本充满恐怖与悬疑的废弃城市场景，玩家需要探索城市的各个角落，解开谜题，寻找隐藏的线索，难度较高。
妖域征途：
这个副本充满奇幻与危险的妖兽领地，玩家需要面对各种妖兽和变异生物，同时应对复杂的地理环境和气候变化，难度极高。
神庙争锋：
这是一个限时活动副本，每周日12:00-14:00开启，6名玩家将在神庙山脚的禁地之中同台竞技，击败敌对玩家可获得战意值，最终根据战意值多少来进行排名，奖励包括游历点、黄龙丹等。
天脉劫：
这也是一个限时活动副本，每周六12:00-24:00开启，6名玩家共同参与1v5的乱斗，最终根据排名获得奖励。
问鼎江湖：
这个副本在每周四、周六的19:50-20:20开启，玩家将组成3人小队，进行3v3组队竞技，共计五轮，最终按排名进行奖励。
东山问战：
这个副本在每周二、周四、周六的10:00-12:00、16:00-18:00开启，玩家之间5v5团队作战，占据地图中央的积分点，先到达1000分即为获胜。
天一演阵：
这个副本在每周日的12:00-24:00开启，玩家需要进行3v3组队竞技，共计五轮，最终按排名进行奖励。
宗师对决、 雪球乱斗、 龙门绝境、 惩凶除恶、 余年剧场、 世界枭雄、 裂土纷争：
这些也是限时活动副本，玩家可以在特定的时间段内参与，获得不同的奖励。
帮派副本：
包括日常副本、高级副本、活动副本等，玩家可以与帮派成员携手合作，共同挑战强大的敌人，获取丰厚的奖励。
这些副本涵盖了剧情探索、角色成长、装备获取和竞技对战等多种玩法，为玩家提供了丰富的游戏体验。建议玩家根据自己的等级和兴趣选择合适的副本进行挑战。