剑网三手游中的灵石有多种用途，主要包括：
提炼装备：
灵石可以用于提炼装备，具体操作是在开封的铁匠处进行打造装备。
镶嵌装备：
灵石可以镶嵌到装备上，镶嵌的灵石等级越高，装备可提升的属性也越高，同时战力也会得到相应的提升。
升级武器：
灵石还可以用于升级武器，成功升级后武器等级+1，失败后武器等级减少1或者不减少，但灵石会消失。
补充红心：
在下FB（副本）时，灵石可以用来补充红心，即恢复生命值。
制作材料：
灵石也是高级制作材料的来源，可以用来制作各种物品，并且出售以换取游戏货币。
副职制作：
灵石对于副职的制作也有重要作用，例如3级副职的制作需要灵石。
综上所述，灵石在剑网三手游中是一个非常重要的资源，用于装备的打造、升级和制作等多种用途，建议玩家合理使用灵石以提升角色的战斗力和游戏体验。