云顶手游没有并入端游的原因主要有以下几点：
操作方式的不同
端游的设计是为电脑屏幕服务的，很多操作在手机上难以实现。例如，端游中的非指向性技能在手游中很难打中人，因为手游的操作方式和屏幕大小限制使得精准操作变得困难。
手机端没有右键，这使得需要复杂操作的阵容在手机上难以操作，比如换阵容、调位置、手动给装备等操作在手机端显得非常麻烦。
游戏体验的差异
云顶手游的操作难度和电脑端相比有所降低，这可能导致手游玩家和电脑端玩家之间的游戏体验存在较大差异，从而影响游戏的公平性和竞技性。
数据互通问题
主要数据不能互通是一个遗憾，玩家在电脑端和手机端之间的战绩无法共享，这可能会增加玩家的负担，需要同时肝PC和手游。
网络线路和服务器负载
早期网络线路的限制使得单一服务器模组无法承受太大的量，因此采用了分区服务器的设计。这种设计在早期是合理的，但随着技术的发展和玩家数量的增长，分区服务器可能成为限制因素。
市场策略和运营考虑
从市场策略和运营角度来看，保持端游和手游的独立性可以吸引不同类型的玩家群体，满足不同玩家的需求和偏好。同时，端游和手游的氪金点不同，手游的皮肤等对云顶玩家来说可能毫无吸引力。
综上所述，云顶手游没有并入端游主要是由于操作方式、游戏体验、数据互通、网络线路和服务器负载以及市场策略等多方面的原因。这些因素共同作用，使得云顶手游和端游各自独立运营，以满足不同玩家的需求和期望。